Mae pwmp gwactod pwysedd negyddol yn gweithio trwy echdynnu moleciwlau nwy yn fecanyddol neu'n gorfforol o ofod wedi'i selio, gan greu amgylchedd pwysedd negyddol o dan bwysau atmosfferig o fewn y siambr bwmpio. Ei egwyddor graidd yw'r cylchdroi cyflym neu'r symudiad cilyddol o rannau symudol fel rotorau, llafnau, neu vortices, sy'n tynnu nwy i mewn trwy'r fewnfa, yn ei gywasgu, ac yna'n ei ollwng trwy'r allfa, gan gyflawni amgylchedd gwactod. Gellir rhannu'r broses benodol i'r tri cham canlynol:
Cam Derbyn: Mae nwy yn mynd i mewn i'r siambr bwmpio trwy'r porthladd derbyn (ee, diamedr 40mm). Ar yr adeg hon, mae'r rotor neu'r llafnau'n symud, gan gynyddu cyfaint y siambr a lleihau'r pwysau mewnol.
Cam Cywasgu: Wrth i'r rhannau symudol barhau i gylchdroi (ee, 1470 RPM), mae'r nwy yn cael ei gywasgu i'r pwysedd gollwng (ee, pwysedd anwedd dŵr 32 mbar).
Cam Rhyddhau: Mae'r nwy cywasgedig yn cael ei ollwng trwy'r falf rhyddhau. Ar yr un pryd, mae'r system iro olew (ee, math olew UL19) yn sicrhau selio a disipiad gwres (tymheredd gweithredu 12-40 gradd).